医院设有呼吸内科、神经内科、血液风湿科、内分泌科、心内科、肾内科、消化内科、肿瘤内科、疼痛科、放疗科、神经外科、胸心外科、骨科、泌尿外科、胃肠外科、肛肠科、肝胆外科、头颈乳腺外科、介入科、妇科、产科、中医妇科、儿科、小儿外科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、中医内科、中医男科、感染科、康复科、理疗科、重症医学科、皮肤科、烧伤整形科、体检中心、核医学科、高压氧门诊、影像科、CT/MRI室、超声科、放射科、检验科、供应室、药学部、心电图室、输血科、内镜中心、病理科、麻醉科等临床科室和医技科室。
一、福建省市级医学重点专科：肿瘤科、中西医结合肝病科、感染科。
二、龙岩市重点专科：呼吸内科、消化内科、骨科、泌尿外科、肝胆外科、重症医学科、妇科、中西医结合肝病科、感染科。
三、龙岩市重点培育专科：风湿免疫科、肛肠科、神经内科、眼科、心血管内科。
一、优势病种：重症肝炎、慢性肝衰竭、肝硬化腹水、上消化道出血、肝性脑病、脂肪肝、自身免疫性肝炎、药物性肝炎、肝豆状核变性、布鲁氏菌病、各型病毒性肝炎、艾滋病、麻疹、功能性消化不良、胃食管反流病、肠易激综合征、炎症性肠病、胰腺炎、肝硬化、胃肠道肿瘤、肺气肿、肺炎、自发性气胸、胸腔积液、肺结核、支气管扩张、肺癌、肺癌、乳腺癌、恶性淋巴瘤、胃肠道癌、恶性间质瘤、头颈部癌、主动脉夹层撕裂、顽固性心力衰竭、恶性心律失常、宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌。
二、优势技术：内镜下黏膜剥离术、内镜下黏膜切除术、贲门失弛缓症POEM术、消化道息肉内镜下摘除术、急性脑梗死静脉溶栓治疗、神经康复、位置性眩晕手法复位术、腹腔镜及后腹腔镜下肾上腺肿瘤切除术、腹腔镜及后腹腔镜下肾盂癌根治术、双镜联合下保胆取石术、双镜联合下胆总管切开取石术、腹腔镜下疝无张力修补术、大隐静脉腔内激光治疗术、肝门部胆管癌根治术、胆囊癌根治术、门静脉高压症贲门周血管离断术、胰管切开取石空肠内引流术、腹腔镜辅助小切口胆总管切开取石术、腹腔镜肝切除术、脊柱骨折经皮置钉复位内固定术、颈（腰）椎间盘突出症微创手术、微创椎体后突成形术、小切口全髋关节置换、经阴道非脱垂子宫切除及经阴道子宫肌瘤剜除术。
